المؤسسة الخيرية الملكية أسسها صاحب الجلالة الملك حمد بن عيسى آل خليفة ملك مملكة البحرين بتاريخ 14 يوليو/ تموز لعام 2001م لكفالة الأيتام البحرينيين من الأسر المستحقة، كما صدر أمر ثان من جلالته في تاريخ 4 نوفمبر/ تشرين الثاني لعام 2001م بتكليف المؤسسة بكفالة الأرامل اللاتي لا عائل لهن.

وفي 27 نوفمبر من عام 2007م صدر عن جلالته أمر ملكي بإعادة تنظيم المؤسسة الخيرية الملكية ليكون جلالته رئيسا فخريا لها ويتولى سمو الشيخ ناصر بن حمد آل خليفة نجل جلالة الملك رئاسة مجلس الأمناء فيها، لتتولى المؤسسة القيام بأعمال الخير والبر والإحسان والنهوض بدور انساني واجتماعي واقتصادي يعود بالنفع على المواطنين وتتولى القيام بكفالة الأرامل والأيتام ورعاية المسنين وذوي الاحتياجات الخاصة وتقديم المساعدات الاجتماعية والصحية والتعليمية والمساهمة في تخفيف الأعباء المعيشية عن الأسر المحتاجة وكذلك المساهمة في إنشاء وتنمية المشاريع الاجتماعية والخيرية غير الربحية كدور الأيتام ورعاية الطفولة والمعوقين ومراكز المسنين ورياض الأطفال وتأهيل الأسر المحتاجة ومراكز التأهيل الصحي والمساهمة في أعمال التنمية المستدامة كدعم برنامج إنشاء المشاريع الصغيرة والمتوسطة وتخصيص الاراضي للمشاريع الاجتماعية والخيرية والتنسيق مع الأجهزة الحكومية المكلفة بتنفيذ برامج ومشاريع في هذا المجال وأية أعمال خيرية أخرى يأمر بها جلالة الملك الرئيس الفخري للمؤسسة أو يقرها مجلس الأمناء.